En 1949, los franciscanos regresaron a Izamal, Yucatán; en 1952, a Tenosique, Tabasco, esta misión
abarca territorialmente parte de Chiapas, como Palenque y Playas de Catazajá.
En 1966, se encomendó a la Orden la Parroquia de Tapilula, que abarca varios municiíos y poblados:
Ixhuatán, Tapilula, Rayón, Pueblo Nuevo, Jitotol, Pantepec y Tapalapa.
En 1965, en el aún territorio de Quintana Roo, los frailes menores asumieron la Parroquia de San
Pedro y San Pablo, que abarca desde la bahía de Chetumal hasta la frontera con Campeche.
A principios de la década de los años 70, se les econmendó la mayor parte del territorio zoque, los
municipios de Tecpatán, Malpaso, Copainalá, Coapilla, Ocotepec, Plan de Ayala, Ostuacán y
Chapultenango. También en estas fechas se recibieron las parroquias de Champotón, Campeche y la
Iglesia de Santa Ana en la Capital del mismo Estado.